Завершение расследования можно признать лишь частичным. Под стражей сейчас находятся лишь два человека, которых следствие считает пособниками предполагаемого организатора и исполнителя теракта – Павла Косолапова, находящегося в розыске.
Неясно, как именно Косолапов был связан с арестованными Саланбеком Дзахкиевым и Макшарипом Хидриевым.
Скорее всего, отправить дело в суд в таком виде СКП заставили обстоятельства: Дзахкиев и Макшарипом Хидриев находятся под стражей с осени 2007 года, скоро истечет максимально возможный срок содержания под арестом, и, если дело не передать в суд, подозреваемых придется отпустить.
Поезд, следовавший из Москвы в Петербург, был подорван в Новгородской области, никто не погиб, однако около 60 человек получили травмы.
Сперва следствие задержало троих подозреваемых, которых потом пришлось отпустить. Впоследствии были задержаны жители Ингушетии Амирхан и Макшарип Хидриевы и Саланбек Дзахкиев.
Первого из троих отпустили в апреле 2008 года, дело против него было прекращено. В августе того же года следствие назвало организатором и исполнителем преступления Павла Косолапова, который еще с 2003 года подозревался в совершении множества терактов.
Следствие посчитало Косолапова причастным к подрыву "Невского экспресса" из-за того, что в бомбу были вмонтированы такие же электронные часы, какие были найдены в подмосковной квартире, где, предположительно, некоторое время скрывался Косолапов.
Адвокат Хидриева заявил, что следствие опирается не на улики, а на предположения. Так, по словам защитника, в домах подозреваемых не проводились обыски, а следствие не проверяло алиби братьев Хидриевых.
В частности, оно не заинтересовалось расшифровкой их телефонных переговоров, по которой, по мнению адвоката, можно установить, где именно они находились в момент теракта.